故事背景设定在抗日战争时期。为了到敌后刺探情报和暗杀敌方将领的任务，国民党情报机构特别组建了一个全部由女子组成的小分队。这些女子在经过严格的训练后，被派往敌后进行活动。她们靠机智勇敢和顽强不屈的精神完成了一个又一个看似不可能的任务，为抗日作出了巨大贡献。
主要剧情涉及民族资本家王尧翁与国民党军长于子才的合作，训练这支女子别动队。首次行动，女子别动队成功铲除了勾结日伪汉奸的黑社会头子田八，但付出了年轻队员贾萍的生命。然而，随着时局的变化，王尧翁和于子才为了私利投入了汉奸的怀抱，导致女子别动队遭受重大打击。最终，幸存的队员菲菲和阿芳手刃了王尧翁和杨干乔等汉奸，但菲菲不幸牺牲。
电视剧《血色玫瑰2之女子别动队》：
该剧讲述了年抗日战争进入相持阶段，龙虎山抗日游击支队女子别动队与日本人进行浴血奋战的故事。她们先后完成了夺取藏宝图、截获“”细菌样品、保护国家文物、运出盘尼西林、夺取特高科密码本、营救重要人物等异常艰难的任务，最终粉碎了敌人的细菌战。
以上两个版本的剧情都展现了女子别动队在抗日战争中的英勇形象，但具体情节和人物设定有所不同。